近期,我院物理教研室陈建中教授作为第一作者连续发表4篇高水平学术论文,其研究成果分别发表在国际知名期刊Journal of Chemical Information and Modeling,ACS Chemical Neuroscience和Computers in Biology and Medicine,发表时间均为2021年。陈建中教授研究成果的主要内容为基于高斯型加速分子动力学增强靶标蛋白构象采样,所发表的期刊均为SCI二区期刊,期刊最新影响因子均超过4.4,属于我校B类期刊。
靶标蛋白的构象变化是药物设计必备的动力学信息,充分合理的构象采样有助于药物靶点识别的准确性。由于能垒的存在,传统的经典分子动力学存在构象采样陷于局部能量最小空间的可能性,诱使构象采样的非充分性和机理信息的非准确性。当前研究成果采用高斯型加速分子动力学克服构象的能垒问题,进而增强了靶标蛋白的构象采样,有助于推动物理学和生命科学领域的学科交叉与发展。研究成果设置了合理的研究方案,有效地研究了定点变异对分子开关K-Ras活性调节的分子机理,阐明了pH环境所介导的质子化对配体与早老性痴呆病靶标蛋白(BACE1)结合的影响和探索了抑制剂与p38α MAP激酶相互作用的分子机理。通过系统研究,获得的分子基础不仅能为相应靶标蛋白抑制剂的研发提供有用的能量基础和构象变化的热力学信息,而且能在物理机制上为药物学、病理学和生命科学等学科的相互深入交叉和发展提供新思路。